Im normalfall nicht..
Glaub auch nicht das Du die FH neu anlernen musst...
Einzig die Radiosender musste neu anlernen 
Also worum es dir wohl geht, nein du kannst durch abklemmen der Batterie nichts wirklich "kaputt" löschen. Die Radiosender sind weg, die Durchschnittsverbräuche und Datum/Uhrzeit etc. je nachdem wie lang abgeklemmt war.
Beim Abklemmen, vor allem beim Anklemmen daran denken alle Verbraucher auszuschalten, müssen ja nicht unbedingt Funken fliegen 
Also Schlüsselabziehen, Türen zu...lediglich Kofferraumbeleuchtung lässt sich nicht umgehen, weil man muss ja irgendwie anklemmen.
Ich weiss nicht was dein Modul noch so alles kann, aber du solltest das Verdeck niemals während der Fahrt öffnen. Es geht sicherlich, aber bedeutet Mehrbelastung für das gesamte Verdecksystem, was angesichts evtl. hoher Reparaturkosten nicht sinnvoll ist.
