Das hintere Fenster muss sauber in seinen Führungsschienen laufen, dann sollte es auch ganz runtergehen
Im Zweifelsfalle ein bisschen Silikonöl o.Ä in den Führungen applizieren. Einfach nicht zuviel, sonst schmiert's dir das über Wochen über das ganze Fenster, wenn du es öffnest oder schliesst.
Ein Trick, den ich anwende ist, dass ich die Führungsschienen nie ganz anziehe, um so das Fenster besser einklipsen zu können. Ich ziehe die Schienen erst an, wenn das Fenster eingeklipst ist. Hatte selbiges Problem mit Nachbau-Scheibenhebern (jedoch vorn).