Also guck mal wier haben hier den Nehmer und Geber 
das sind die Zwei Teile, eins kostet 189€ und das andere 100€ + MWST / - dort wird auch das Leck sein
- also am Teil das 189€ kostet (so wars bei mir)
hier Teilnr 8
http://de.bmwfans.info/parts/c…clutch_control_m_gearbox/
und hier Teilnr. 1
http://de.bmwfans.info/parts/c…se/clutch/clutch_control/
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Das Teil das 350€ kostet ist der Druckspeicher
http://de.bmwfans.info/parts/catalog/E46/Coupe/Europe/M3-S54/LHD/N/2004/april/browse/clutch/clutch_control_m_gearbox/
Teil nr. 2.
Der Einbau der Geber / Nehmerzylinder geht 30-45min. Der EInbau des Drucksspeichers geht ca 1.5-2h weil da die Airbox runte rmuss, da die Hydraulikeinheit mit dem Speicher darunter sitz und das ist ein scheiss :D.
Ähh.. jaa dann wird er dir was erzählen von entlüften .. das dauert eeewig (sagt er) dagegen geht das 10-20min. Das macht nämlich die Software.
Man baut alles zusammen, befüllt den Behälter mit Pentosin CHF 11 (Hydraulikflüssigkeit) und startet dann mit Inpa die Entlüftung, dauert 10min und man muss evtl bissl nach kippen.
Dann noch schnell die Kupplung neu anlernen (10min) und das wars.! Freude am Fahren 
Also könnten die 600€ komplett zusammen kommen. Und du hast glück mit deinem Händler.. die meißten wollen dir ne neue Hydraulikeinheit verkaufen
die kostet 1500€
oder ein neues GEtriebe 
Das mit dem Motorgeräusch.. hmm ich denke vll täuscht es und es ist nicht der Motor sondern die Hydraulikeinheit, da wie gesagt die EInheit unter der Airbox sitzt. 