Also ich hab mitlerweile viel getestet und bin beim schmieren (wo die Scheiben reinfahren) nicht glücklicher geworden... Aus verzweiflung einfach mal nen Arbeitskollegen gefragt, der mitlerweile schon drei E46 fuhr und jedes mal das selbe Problem hatte.. Das damit gelöst wurde.
Er meinte das die Fenster auch knarzen können, jedoch es meistens am Shadowline bzw. an den Regenleisten liegt..
Das heißt dort wo der Rote Pfeil ist
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muss geschmiert werden.. Und zwar ganz einfach aus dem Grund, weil wenn das Fenster in die Dichtung oben fährt, drückt das Fenster den hart gewordenen Gummi (Roter Pfeil) weiter nach innen, und somit an die Shadowline bzw. Regenleiste...
Wenn man jetzt über unebenheiten fährt oder sonstiges, schlägt dieser immer dagegen und fängt an zu scheppern.. Ganz einfach zu testen einfach bei der Leiste dagegenklopfen dann macht es genau die Geräusche..
Schmiert man dieses mit Sprühfett oder sonstigem ein, wird der Gummi bzw. Kunststoff wieder "angegriffen" und wird weicher. Was zur folge hat, das sich dieser wieder etwas verformt und nicht mehr so arg dagegenschlägt..
Heute das erste mal eingeschmiert (beim Roten Pfeil) und das knarzen ist fast vollständig weg. Morgen nochmal einschmieren und ich hoffe ich bin das Problem endlich los..
Hab es selber nicht geglaubt.. Aber testen und schlauer sein 
der löst die ein bisschen an und macht sie auch weich.
