Hast du das Rädchen zwischen den mittleren Luftsausströmern auf dem Amaturenbrett verstellt? Also von rot auf blau? Das wäre zumindest eine sehr einfache Erklärung.
'n Abend.
Weiß nicht wie's bei der Klima-Automatik ist (hab leider nur 'ne manuelle), aber ich hab oben an den mittleren Lüftungsdüsen (über dem Radio) noch ein drittes Einstellrad, mit dem ich die Temperaturverteilung oben/unten getrennt regeln kann. Gibt's sowas bei dir und hast du damit schon mal "rumgespielt"?
Gruß
ZwoCa
Das selbe Problem mit den gleichen Sympthomen wie User Boosas hat ein Freund von mir auch!
Wir rätseln auch schon länger am Problem aber kommen auf keine Ursache 
.
Folgende Fragen stellen wir uns:
1. Kann es sein, dass das Klimabedienteil selber bzw. der Temperatursensor der verbaut ist, defekt ist?
2. Wie ist der Aufbau der Lüftung?
Verfügen die Ausgänge "Oben", "Mitte" und "Unten" über je einen Luftkanal oder versorgt ein zentraler Kanal alle 3 Ausgänge mit Luft?
3. Kann es ein Heizungsventil sein, das nicht richtig schließt bzw. öffnet?
Hoffe wir können das Problem gemeinsam lösen 
Das Drehrad oben in der Mitte dient im Prinzip nur dazu, den Oberkörper-Lüftungsdüsen mehr/weniger Kaltluft zuzumischen.
Hast du mal die einzelnen Kanäle ohne Automatik durchtestet?
Also was passiert z.B. wenn du nur auf Fußraum stellst und mal unterschiedliche Temperaturen durchgehst?
Die unterschiedlichen Konstellationen und Ergebnisse würden es einfacher machen, dass Problem zu erkennen.
Ansonsten ist es so, dass die Klimaautomatik über 3 Stellmotoren verfügt, die für jeden Kanal einzeln den Luftdurchsatz regulieren können (bei der manuellen Klimaanlage gibt's im Vergleich dazu nur einen Stellmotor, der alle 3 Kanäle gleichzeitig bedient).
Falls du Zugriff auf INPA hast könntest du da mal reinschauen. Ich bin mir nicht sicher, aber im IHKA gibt's bestimmt 'ne Ansteuerfunktion für die einzelnen Stellmotoren und 'ne Möglichkeit sich die Werte (mit denen die Automatik die Stellmotoren steuert) anzeigen zu lassen.